Site Genotype1 JD-pop ND-pop RD-pop Total-pop Genotype2 JD-pop ND-pop RD-pop Total-pop Genotype3 JD-pop ND-pop RD-pop Total-pop JD-chi2 ND-chi2 RD-chi2 Total-chi2 000434 AA 20 20 23 63 AG 1 3 1 5 GG 1 0 0 1 9.075 0.112 0.011 4.228 000537 -- 17 15 23 55 +- 1 4 1 6 ++ 0 0 0 0 0.015 0.263 0.011 0.163 000637 AA 0 0 0 0 AG 0 1 0 1 GG 22 23 24 69 0.000 0.011 0.000 0.004 000670 AA 22 22 21 65 AG 0 2 3 5 GG 0 0 0 0 0.000 0.045 0.107 0.096 000752 AA 0 0 0 0 AG 0 4 1 5 GG 22 19 23 64 0.000 0.209 0.011 0.098 000797 AA 0 0 1 1 AG 0 7 7 14 GG 23 16 16 55 0.000 0.741 0.044 0.010 001472 CC 21 20 23 64 CT 2 4 1 7 TT 0 0 0 0 0.048 0.198 0.011 0.191 001810 CC 21 18 20 59 CT 1 1 3 5 TT 0 0 0 0 0.012 0.014 0.112 0.106 002315 GG 12 23 18 53 GT 6 1 4 11 TT 4 0 1 5 3.035 0.011 1.252 10.078 002391 CC 0 0 1 1 CG 1 1 4 6 GG 18 22 19 59 0.014 0.011 1.361 2.683 002425 CC 22 24 24 70 CT 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.004 002457 AA 0 0 0 0 AC 5 0 0 5 CC 18 24 24 66 0.342 0.000 0.000 0.095 002563 CC 0 0 0 0 CT 8 2 3 13 TT 15 22 21 58 1.019 0.045 0.107 0.721 002769 AA 0 0 0 0 AG 3 0 0 3 GG 17 23 24 64 0.131 0.000 0.000 0.035 003099 AA 0 0 0 0 AG 1 0 0 1 GG 18 24 24 66 0.014 0.000 0.000 0.004 003580 CC 22 20 20 62 CT 1 4 3 8 TT 0 0 0 0 0.011 0.198 0.112 0.257 003659 AA 0 0 1 1 AG 0 6 5 11 GG 22 18 18 58 0.000 0.490 0.644 0.316 003691 AA 15 22 21 58 AG 7 2 3 12 GG 0 0 0 0 0.787 0.045 0.107 0.615 003710 AA 21 24 24 69 AG 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.004 003727 AA 0 0 0 0 AG 0 0 1 1 GG 22 24 23 69 0.000 0.000 0.011 0.004 003835 CC 15 16 22 53 CT 5 8 2 15 TT 1 0 0 1 0.429 0.960 0.045 0.003 003950 AA 1 0 0 1 AG 2 8 2 12 GG 19 16 22 57 4.455 0.960 0.045 0.159 004024 AA 3 13 14 30 AG 7 11 9 27 GG 10 0 1 11 0.818 2.121 0.091 1.307 031518 AA 0 0 0 0 AG 0 1 0 1 GG 23 22 24 69 0.000 0.011 0.000 0.004 031563 -- 0 1 8 9 +- 1 17 13 31 ++ 22 5 0 27 0.011 6.324 4.220 0.000 031672 AA 0 0 0 0 AC 0 1 4 5 CC 23 22 20 65 0.000 0.011 0.198 0.096 031713 AA 0 0 0 0 AT 9 7 5 21 TT 15 17 17 49 1.278 0.700 0.362 2.180 031804 AA 0 0 0 0 AC 5 0 0 5 CC 18 24 24 66 0.342 0.000 0.000 0.095 031966 AA 0 0 0 0 AG 2 0 0 2 GG 18 23 24 65 0.055 0.000 0.000 0.015 032331 AA 0 0 0 0 AC 0 4 1 5 CC 18 18 21 57 0.000 0.220 0.012 0.109 032362 AA 0 0 0 0 AG 0 2 2 4 GG 18 22 21 61 0.000 0.045 0.048 0.066 032372 CC 0 0 0 0 CT 2 9 7 18 TT 16 13 16 45 0.062 1.455 0.741 1.750 032581 AA 0 0 0 0 AC 1 0 0 1 CC 23 24 24 71 0.011 0.000 0.000 0.004 032590 AA 24 18 23 65 AG 0 6 1 7 GG 0 0 0 0 0.000 0.490 0.011 0.188 032596 AA 1 0 0 1 AG 9 0 0 9 GG 14 24 24 62 0.091 0.000 0.000 0.938 032732 AA 10 5 10 25 AG 10 14 13 37 GG 3 5 1 9 0.040 0.667 1.630 0.682 032851 CC 0 0 0 0 CG 6 0 0 6 GG 16 24 24 64 0.548 0.000 0.000 0.140 033133 AA 10 5 10 25 AG 11 14 13 38 GG 3 5 1 9 0.000 0.667 1.630 0.877 033201 AA 14 17 17 48 AG 9 7 7 23 GG 0 0 0 0 1.361 0.700 0.700 2.652 033251 AA 0 0 0 0 AG 5 0 1 6 GG 18 24 23 65 0.342 0.000 0.011 0.138 033391 CC 17 20 22 59 CT 6 4 2 12 TT 0 0 0 0 0.517 0.198 0.045 0.605 033392 AA 0 0 0 0 AG 4 0 1 5 GG 19 24 23 66 0.209 0.000 0.011 0.095 033502 CC 0 3 0 3 CT 1 11 8 20 TT 23 10 16 49 0.011 0.000 0.960 0.270 033909 CC 20 24 24 68 CT 2 0 0 2 TT 0 0 0 0 0.050 0.000 0.000 0.015 034043 CC 14 24 24 62 CT 6 0 0 6 TT 0 0 0 0 0.623 0.000 0.000 0.145 034093 CC 21 20 21 62 CG 0 4 3 7 GG 0 0 0 0 0.000 0.198 0.107 0.197 034379 CC 19 24 24 67 CT 2 0 0 2 TT 0 0 0 0 0.053 0.000 0.000 0.015 039372 GG 21 24 24 69 GT 3 0 0 3 TT 0 0 0 0 0.107 0.000 0.000 0.033 039425 AA 0 0 0 0 AG 0 1 2 3 GG 24 23 22 69 0.000 0.011 0.045 0.033 039431 AA 0 0 0 0 AC 1 3 3 7 CC 23 21 21 65 0.011 0.107 0.107 0.188 039481 AA 3 5 10 18 AC 14 14 13 41 CC 6 5 1 12 1.308 0.667 1.630 1.892 039684 CC 18 24 24 66 CT 6 0 0 6 TT 0 0 0 0 0.490 0.000 0.000 0.136 039716 CC 22 24 24 70 CT 2 0 0 2 TT 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.014 039717 AA 0 0 0 0 AG 1 7 5 13 GG 23 17 19 59 0.011 0.700 0.324 0.709 039830 CC 24 24 23 71 CT 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0.000 0.000 0.011 0.004 040020 AA 11 11 4 26 AC 8 9 10 27 CC 4 3 10 17 1.252 0.277 0.296 3.254 040031 AA 11 10 4 25 AG 8 10 10 28 GG 4 3 10 17 1.252 0.040 0.296 2.511 040035 -- 11 11 4 26 +- 8 10 10 28 ++ 4 3 10 17 1.252 0.094 0.296 2.794 040178 CC 4 7 14 25 CT 8 9 6 23 TT 11 8 4 23 1.252 1.484 3.744 8.777 040205 CC 11 10 4 25 CT 8 10 10 28 TT 4 4 10 18 1.252 0.296 0.296 2.941 040230 CC 0 0 0 0 CT 12 0 0 12 TT 34 40 48 122 1.035 0.000 0.000 0.294 040524 AA 0 0 0 0 AG 0 0 2 2 GG 48 48 46 142 0.000 0.000 0.022 0.007 040652 GG 0 0 0 0 GT 0 6 0 6 TT 48 38 48 134 0.000 0.236 0.000 0.067 040811 CC 48 38 46 132 CT 0 8 2 10 TT 0 0 0 0 0.000 0.417 0.022 0.189 040813 CC 4 0 0 4 CG 30 20 16 66 GG 12 28 32 72 5.476 3.324 1.920 6.036 040821 CC 28 42 46 116 CT 18 6 2 26 TT 2 0 0 2 0.181 0.213 0.022 0.153 040896 CC 1 1 0 2 CT 7 11 7 25 TT 15 12 17 44 0.025 0.618 0.700 0.493 041158 CC 18 2 1 21 CG 5 14 10 29 GG 1 8 13 22 0.644 1.434 0.296 2.718 041189 GG 0 2 9 11 GT 5 17 14 36 TT 19 5 1 25 0.324 4.629 2.344 0.111 041252 AA 1 0 0 1 AG 8 0 0 8 GG 15 24 24 63 0.003 0.000 0.000 1.417 041260 CC 20 24 24 68 CT 4 0 0 4 TT 0 0 0 0 0.198 0.000 0.000 0.059 041452 AA 24 22 24 70 AG 0 2 0 2 GG 0 0 0 0 0.000 0.045 0.000 0.014 041571 CC 11 11 9 31 CT 12 11 10 33 TT 1 1 4 6 1.059 0.741 0.175 0.456 041705 AA 8 0 0 8 AG 12 4 2 18 GG 4 20 22 46 0.020 0.198 0.045 6.784 041710 AA 0 0 3 3 AT 4 4 8 16 TT 20 20 13 53 0.198 0.198 0.897 1.443 041869 AA 6 0 0 6 AG 13 2 2 17 GG 3 18 22 43 0.917 0.055 0.045 4.084 041886 CC 14 13 21 48 CT 7 6 3 16 TT 0 1 0 1 0.840 0.078 0.107 0.066 041934 CC 5 0 0 5 CT 12 2 2 16 TT 5 21 22 48 0.182 0.048 0.045 4.033 042153 CC 21 14 20 55 CT 1 6 3 10 TT 0 1 0 1 0.012 0.114 0.112 0.458 042197 AA 0 0 0 0 AG 2 0 0 2 GG 20 21 24 65 0.050 0.000 0.000 0.015 042259 CC 21 21 23 65 CT 2 0 1 3 TT 0 0 0 0 0.048 0.000 0.011 0.035 042375 CC 9 0 0 9 CT 10 2 2 14 TT 3 19 22 44 0.007 0.053 0.045 12.116 042383 CC 0 0 0 0 CT 1 0 0 1 TT 21 21 24 66 0.012 0.000 0.000 0.004 042392 CC 2 13 19 34 CT 5 6 5 16 TT 15 2 0 17 2.001 0.948 0.324 16.055 042609 CC 9 0 0 9 CT 10 2 2 14 TT 3 19 22 44 0.007 0.053 0.045 12.116 042808 CC 4 24 23 51 CT 13 0 1 14 TT 7 0 0 7 0.243 0.000 0.011 10.359 042977 CC 0 0 0 0 CT 1 0 0 1 TT 23 24 24 71 0.011 0.000 0.000 0.004 043010 -- 0 0 0 0 +- 2 0 0 2 ++ 22 24 24 70 0.045 0.000 0.000 0.014 043176 CC 15 2 0 17 CT 6 8 5 19 TT 3 14 19 36 2.667 0.296 0.324 13.482 043428 AA 0 0 0 0 AG 6 0 0 6 GG 18 24 24 66 0.490 0.000 0.000 0.136 043670 CC 17 16 21 54 CG 7 7 3 17 GG 0 1 0 1 0.700 0.044 0.107 0.068 043701 GG 21 3 4 28 GT 2 15 13 30 TT 1 6 7 14 4.959 1.748 0.243 1.291 043926 CC 23 24 24 71 CT 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.004 044208 AA 6 14 20 40 AC 12 8 4 24 CC 6 2 0 8 0.000 0.296 0.198 2.062 044535 CC 24 20 23 67 CT 0 4 1 5 TT 0 0 0 0 0.000 0.198 0.011 0.093 044633 AA 9 24 24 57 AG 12 0 0 12 GG 2 0 0 2 0.517 0.000 0.000 1.701 045051 AA 1 0 0 1 AT 6 0 1 7 TT 10 24 23 57 0.006 0.000 0.011 1.756 045130 GG 10 19 12 41 GT 5 5 9 19 TT 0 0 3 3 0.600 0.324 0.389 0.170 045310 CC 16 17 11 44 CT 2 6 9 17 TT 0 1 3 4 0.062 0.240 0.277 1.625 045409 -- 19 24 23 66 +- 1 0 1 2 ++ 0 0 0 0 0.013 0.000 0.011 0.015 045543 CC 19 24 24 67 CT 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0.013 0.000 0.000 0.004 045548 AA 2 10 8 20 AG 5 11 13 29 GG 13 3 3 19 1.604 0.000 0.421 1.467 045600 GG 0 1 0 1 GT 0 6 3 9 TT 19 15 21 55 0.000 0.153 0.107 0.733 045622 AA 4 19 12 35 AG 9 5 9 23 GG 6 0 2 8 0.034 0.324 0.028 1.752 045719 CC 0 0 0 0 CG 0 0 1 1 GG 20 24 23 67 0.000 0.000 0.011 0.004 045751 CC 0 0 0 0 CT 2 4 1 7 TT 19 20 23 62 0.053 0.198 0.011 0.197 046079 AA 0 0 0 0 AG 2 4 1 7 GG 22 20 23 65 0.045 0.198 0.011 0.188 046200 GG 0 0 0 0 GT 2 4 1 7 TT 22 19 23 64 0.045 0.209 0.011 0.191 046375 CC 4 0 0 4 CT 12 2 1 15 TT 8 22 23 53 0.020 0.045 0.011 3.608 046378 AA 14 24 23 61 AT 9 0 1 10 TT 1 0 0 1 0.091 0.000 0.011 0.595 047222 AA 1 0 0 1 AG 11 3 1 15 GG 12 21 23 56 0.618 0.107 0.011 0.000 047370 AA 2 2 0 4 AG 11 7 4 22 GG 11 15 20 46 0.107 0.730 0.198 0.391 047433 AA 0 0 0 0 AG 2 4 2 8 GG 21 20 21 62 0.048 0.198 0.048 0.257 047545 CC 18 24 24 66 CT 6 0 0 6 TT 0 0 0 0 0.490 0.000 0.000 0.136 047615 AA 0 1 0 1 AG 0 6 3 9 GG 24 17 21 62 0.000 0.240 0.107 0.938 047716 AA 0 1 0 1 AG 0 6 3 9 GG 23 17 21 61 0.000 0.240 0.107 0.908 047768 CC 19 24 19 62 CT 5 0 4 9 TT 0 0 0 0 0.324 0.000 0.209 0.325 048052 AA 7 1 3 11 AG 13 15 11 39 GG 3 8 10 21 0.631 3.219 0.000 1.037 048247 AA 0 0 0 0 AG 1 0 0 1 GG 23 24 24 71 0.011 0.000 0.000 0.004 048286 AA 1 0 0 1 AG 11 3 1 15 GG 12 21 23 56 0.618 0.107 0.011 0.000 048445 CC 16 19 12 47 CT 8 5 9 22 TT 0 0 3 3 0.960 0.324 0.389 0.044 048695 GG 0 0 0 0 GT 0 3 1 4 TT 24 21 23 68 0.000 0.107 0.011 0.059 048734 AA 0 0 0 0 AC 2 0 0 2 CC 22 24 24 70 0.045 0.000 0.000 0.014 048809 CC 18 24 24 66 CT 5 0 0 5 TT 0 0 0 0 0.342 0.000 0.000 0.095 Note: JD: Jackson,MS ND: North_Karelia,Finland RD: Rochester,MN Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000537: CT 031563: ACAG 040035: T 043010: G 045409: T