APOA4 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

GTCATGGTTA CCTCCCCACC TCCCCAGCTG CAAGGAGGAT TCATCCGGCA 50
ACCAGTTGAG GCTAGATTCT CAGCAGCTTT ATTGAATATT GAGAGGTGGT 100 | Exon 1 | UTR
CTCACCTCCC ACTGGACATG TGTCCTCAAG TTCATACCAG AACTTCTTTG 150 | var(120):[A:0.01]
GGACAGACAG ACAGACAGGT GGCAGGGCAG GGCAGGTGTC CACGAGGGTG 200 | var(165):[:0.37]
GGGCCAGTGC ACCAGGGGCA GCT
CAGCTCT CCAAAGGGGC CAGCATCTGC 250
                         M  F  L   K  A  V   V  L  T   9
ACCTGCTCCT GCTGCTGCTC CTGCTGCTGT TCCTGCTGTT GCTCCAGCTC 300 | var(274):[A:0.04]
L  A  L  V   A  V  A   G  A  R   A  E  V  S   A  D  Q  26
AGGGAGGGAG AGAGTCTTGT CCTGGCTCTC TTTCTCCTTG AAGGTGCTGA 350 | var(315):[A:0.15]
 V  A  T   V  M  W  D   Y  F  S   Q  L  S   N  N  A  K 43
AGAAGGAGTT GACCTTGTCC CTCAGGTCCT TCTCCAGGAA GCTCAAGTGG 400
  E  A  V   E  H  L   Q  K  S  E   L  T  Q   Q  L  N   59
CCTTCCACGT CCCCCGCATG GGGGCCCAGT TTCTGCCTGA GCTGTTCCAT 450 | var(406):[A:0.04]
A  L  F  Q   D  K  L   G  E  V   N  T  Y  A   G  D  L  76
CTGCTGCACC AGGGCTTTGT TGAAGTTTTC CCCGTAGGGC TCCACCCGGC 500
 Q  K  K   L  V  P  F   A  T  E   L  H  E   R  L  A  K 93
GTCGGAACTC CTCCACCTGC TGGTCCAGGT GCCCACCCAG CTCTGCCAGT 550
  D  S  E   K  L  K   E  E  I  G   K  E  L   E  E  L   109
GACTTCTGCA GCCCCTCGGT GTTGCCCCTC AGGTTGCCAC GCACGTCCTC 600 | var(568):[A:0.01]
R  A  R  L   L  P  H   A  N  E   V  S  Q  K   I  G  D  126
GGCCAAGGGC GCCAGCCTCT GCCGCAGCTC CTCGGCACTG GCCGAGATCC 650
 N  L  R   E  L  Q  Q   R  L  E   P  Y  A   D  Q  L  R 143
TGGCCTTGAG CTCCTCGGCG TTCTTCTTCA TCTGGAAGGT CAGGCCCTCA 700
  T  Q  V   N  T  Q   A  E  Q  L   R  R  Q   L  T  P   159
AGCTGGTGGT TGAGCTTCTC CTGCGTGTCC TGAGCATAGG GAGCCAGGCT 750
Y  A  Q  R   M  E  R   V  L  R   E  N  A  D   S  L  Q  176
GCGGCGCAGC TCCTCCACGG TCTGGTCAAT CTTGACTTTG AATTCGTCAG 800
 A  S  L   R  P  H  A   D  E  L   K  A  K   I  D  Q  N 193
CGTAGGGCGT AAGGCGTCCC TTGAGCTCCT CCACGTTCTG GTCGATCTTG 850
  V  E  E   L  K  G   R  L  T  P   Y  A  D   E  F  K   209
GCCTTGAGCT CGTCGGCGTG GGGCCTCAGC GAGGCCTGCA GGCTGTCGGC 900
V  K  I  D   Q  T  V   E  E  L   R  R  S  L   A  P  Y  226
GTTCTCCCGC AGCACTCTCT CCATGCGCTG TGCGTAGGGG GTCAGCTGGC 950 | var(933):[A:0.04]
 A  Q  D   T  Q  E  K   L  N  H   Q  L  E   G  L  T  F 243
GCCGCAGCTG CTCGGCCTGC GTGTTGACCT GGGTGCGCAG CTGGTCCGCG 1000 | var(964):[A:0.03] | REPEAT | var(974):[C:0.14]
  Q  M  K   K  N  A   E  E  L  K   A  R  I   S  A  S   259
TAGGGCTCCA GGCGCTGCTG AAGCTCTCGC AGGTTGTCCC CGATCTTCTG 1050
A  E  E  L   R  Q  R   L  A  P   L  A  E  D   V  R  G  276
GCTCACCTCA TTGGCATGGG GCAGCAGCCG GGCCCTCAGC TCCTCCAGCT 1100
 N  L  R   G  N  T  E   G  L  Q   K  S  L   A  E  L  G 293
CCTTCCCAAT CTCCTCCTTC AGTTTCTCCG AGTCCTTGGC CAGGCGTTCA 1150
  G  H  L   D  Q  Q   V  E  E  F   R  R  R   V  E  P   309
TGCAGCTCGG TGGCAAAGGG CACCAGCTTC TTCTGCAGGT CACCTGCGT
A 1200 | var(1183):[A:0.01] | var(1192):[G:0.05] | var(1198):[A:0.08]
Y  G  E  N   F  N  K   A  L  V   Q  Q  M  E   Q  L  R  326
AGTGTTCACT TCTCCAAGTT TGTCCTGGAA GAGGGCACTG TGGGGAAGGG 1250
 Q  K  L   G  P  H  A   G  D  V   E  G                 338
CACAAGGAGG CCACGTTACA TTTGGCATTT ACACGGCAAG ACTTTGTCTG 1300
CTTGTATACC ACTCGCCTTA TGCACACGTG CTAAGACAGG TGAGTGCTCA 1350 | var(1334):[G:0.39]
GAGGTACCGA GTTCACCCTC CCTATGGTGG TGCAGATTGG AGAGGATGGG 1400
TGTCACAGAC TAAGTTACGA TGCTGAATTT CTATCTCAGG ATCTCCCACA 1450
TAGTTTGTCT CAGAATCTAC CCACCATGTC ACCTCCAGCA GTTTGCTTTC 1500 | var(1453):[C:0.04]
CCCTCCTTGT CTGCAGAGGG TGGGACTTTG AGGTCCTTCC CAGAGGGAGT 1550
GTTCTGGGCC ATAGGATCAC ATTGTGTAAC ACAATGTTGT CTTCTTGACC 1600
TCTGCTGGGG TCTTCCAGTG GCACAAGGTG CTGCTTTCCT TGCCTGTGCC 1650
CAGGGGCCTC CCAAATATTC CCACCTCCCT CCCCTTGATT CCACTGGGGC 1700
CTGTCTTTCT GAAACGTATT AGAAATCAGC TCACATGACA TTTTCCTCCC 1750 | var(1735):[G:0.39]
TCCCTCTCTT CCATGAGCCT GAATGATAGG ATGTGGCCAT TTGTCAAACT 1800 | REPEAT
CTAGAACGTC AAAGCAAAAG GACATGGCAG GGATTATTCG GTCCAAACTT 1850 | var(1803):[G:0.16]
CCGGTTTACA TATGTGGATC CTAGGTTCAG AGGCCCGGCC AGTTAGTGGC 1900 | var(1853):[A:0.04]
AGGGCAGTGG GTATCCTAAG CTCAGGGCTC CTGTCTCTAA GCTCAACCCT 1950
TGCCAGTACA TTGCATGGCC TTTAAGAATT CCCCGTCACC ACCGCACACT 2000 | var(1993):[T:0.08] | var(1994):[A:0.04]
GTAGTCCCTC TTACTTGAGT TGCTGGGTGA GTTCAGATTT CTGGAGATGT 2050 | Exon 2
               H  L   S  F  L  E   K  D  L   R  D  K   350
TCCACGGCCT CCTTGGCATT GTTGCTCAGC TGGCTGAAGT AGTCCCACAT 2100
V  N  S  F   F  S  T   F  K  E   K  E  S  Q   D  K  T  367
CACTGTGGCC ACCTGGTCAG CACTGACCTC AGCCCTGGCT CCTGGGTGGT 2150 | var(2104):[C:0.18]
 L  S  L   P  E  L  E   Q  Q  Q   E  Q  Q   Q          381
AACAGAGAGC AATTCATGAG GCCCCGTCTC CTGTGTGGCC CCTCTGCTCC 2200
AGCTCTGAGC TGCAGACTGG ATGATGGTGG GGGTGCCTCA ACCTGCCATT 2250
TTCCCTGTCT GAGCTTAGCT TTTTGGAAGC CACAGGGATA TGTGAAACTG 2300
GTATAGCACC AATGCCAATG GGCCCACCAC TGGGACTGGG CCAGCTCTCC 2350
TGTGAGCCAC TTGGCAGCCA GGCAGACCTC ATGTCCAGCT GGGGGCTGAT 2400
GGGCACTCAG AAGTGTCCTT TTGCTTTGGC TCAGCCTCCA TCCTGCACTA 2450
CTCAGAGCAG CAGCCCAGGA GTGCCATCCA AAGACAGCTT CTACTCACCG 2500 | Exon 3
                                                       381
GCGACAGCCA CCAGGGCCAG GGTCAGGACC ACGGCCTTCA GGAACATCCT 2550 | var(2511):[T:0.01] | UTR
E  Q  Q  Q   E  Q  V   Q  M  L   A  P  L  E   S        396
GAGCTGCTTG CTGGGCTGGA GGAGTTTCTT GCCACACTGG ATCCTCCCTA 2600
CAATCAGGGG AGCTGACAGA GAGGTCCTCA GGAGAGCTCA CCTGCGCTGC 2650 | var(2645):[T:0.04]
AGTGGGAACT
GACTGAAGCT CAGAGCCAGC CAGACATTTA AACTCTCTCC 2700 | var(2695):[G:0.05]
CTATCGCCAC CCCCCTGGCT GCCCTCCCCT CCTCCTTCCT CAGTGTGACT 2750
CCACGCTGGA AGGTGACACA TTCCCAAGAG GCCTCTTGGA CTTTTGTGAC 2800
CCTGAGACTA CGTGGAAGCT GACAGCAGAT CAGGGCTCAG GCGATAGTTA 2850
GAAGTGGTGG CTGTTCCGTG CGTGGGCACC CCCACCCCCA CCCCACCAAC 2900
CTCAGCATGG AAGGGAGGAG GGGAACGGAA AACAGTAGGA GAAACACCTC 2950
AGGGAGCCCA TGAGCCCGGG ACTGATGCCT CGAGGCCCTG CTGGCGGCTC 3000 | var(2981):[T:0.01]
TGGGTTTGTG CCGGGCTCAT GGGGGGCAAA GTCCACATCT CCTCTGTCTA 3050
CCCCAGTGAA GACAGGTCCC CCCAGTCTCC ACATCCGCCA CTAATGCTGA 3100
CTCCATCTCA GAGCACCAGA CACTGGAGTG GGACCATCCA GGACTGCAGA 3150
CAGCATAGTG AGCTAAAATC TAGGTCTCTT GTCAAGGTAC ACCCAAGAGG 3200
AGGGGGCCCT GGAGAGCCTT TGGGCAGATG GGTGTGGGAG ACAGGGCCTT 3250
GTCCTGAAAG GGTTAATTGT AGAGTGCTTC ATGTCCCACT CCCATGCTGT 3300 | REPEAT
GCCTCCTTGG TCTAGTTATT CAAAGCCCTG AGCTTCAGTT TCTCCTCTGA 3350
ACAATGGGAT GGTTCAGTAC ATTAAAGAAG ACATTGCTTG CGAAGTGGGT 3400
AGTACGGTCA TCTCTCAGTC TCCATGGGAA ATTGATTCCA GGACCCTCTG 3450 | REPEAT
CAGATACCAA AATCCATGGA TGTTCAAGTC CT