APOE Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

CTTGATGCTC AGAGAGGACA AGTCATTTGC CCAAGGTCAC ACAGCTGGCA 50 | REPEAT
ACTGGCAGAG CCAGGATTCA CGCCCTGGCA ATTTGACTCC AGAATCCTAA 100 | var(73):[T:0.01]
CCTTAACCCA GAAGCACGGC TTCAAGCCCC TGGAAACCAC AATACCTGTG 150
GCAGCCAGGG GGAGGTGCTG GAATCTCATT TCACATGTGG GGAGGGGGCT 200
CCCCTGTGCT CAAGGTCACA ACCAAAGAGG AAGCTGTGAT TAAAACCCAG 250 | REPEAT
GTCCCATTTG CAAAGCCTCG ACTTTTAGCA GGTGCATCAT ACTGTTCCCA 300
CCCCTCCCAT CCCACTTCTG TCCAGCCGCC TAGCCCCACT TTCTTTTTTT 350 | var(308):[T:0.01] | REPEAT
TCTTTTTTTG AGACAGTCTC CCTCTTGCTG AGGCTGGAGT GCAGTGGCGA 400
GATCTCGGCT CACTGTAACC TCCGCCTCCC GGGTTCAAGC GATTCTCCTG 450
CCTCAGCCTC CCAAGTAGCT AGGATTACAG GCGCCCGCCA CCACGCCTGG 500 | var(471):[G:0.01]
CTAACTTTTG TATTTTTAGT AGAGATGGGG TTTCACCATG TTGGCCAGGC 550 | var(545):[T:0.01]
TGGTCTCAAA CTCCTGACCT TAAGTGATTC GCCCACTGTG GCCTCCCAAA 600 | var(560):[T:0.22]
GTGCTGGGAT TACAGGCGTG AGCTACCGCC CCCAGCCCCT CCCATCCCAC 650 | var(624):[C:0.07]
TTCTGTCCAG CCCCCTAGCC CTACTTTCTT TCTGGGATCC AGGAGTCCAG 700
ATCCCCAGCC CCCTCTCCAG ATTACATTCA TCCAGGCACA GGAAAGGACA 750
GGGTCAGGAA AGGAGGACTC TGGGCGGCAG CCTCCACATT CCCCTTCCAC 800
GCTTGGCCCC CAGAATGGAG GAGGGTGTCT GGATTACTGG GCGAGGTGTC 850 | var(832):[T:0.45]
CTCCCTTCCT GGGGACTGTG GGGGGTGGTC AAAAGACCTC TATGCCCCAC 900
CTCCTTCCTC CCTCTGCCCT GCTGTGCCTG GGGCAGGGGG AGAACAGCCC 950
ACCTCGTGAC TGGGGGCTGG CCCAGCCCGC CCTATCCCTG GGGGAGGGGG 1000
CGGGACAGGG GGAGCCCTAT AATTGGACAA GTCTGGGATC CTTGAGTCCT 1050
ACTCAGCCCC AGCGGAGGTG AAGGACGTCC TTCCCCAGGA GCCGGTGAGA 1100 | Exon 1 | UTR
AGCGCAGTCG GGGGCACGGG GATGAGCTCA GGGGCCTCTA GAAAGAGCTG 1150
GGACCCTGGG AAGCCCTGGC CTCCAGGTAG TCTCAGGAGA GCTACTCGGG 1200 | var(1163):[C:0.35]
GTCGGGCTTG GGGAGAGGAG GAGCGGGGGT GAGGCAAGCA GCAGGGGACT 1250
GGACCTGGGA AGGGCTGGGC AGCAGAGACG ACCCGACCCG CTAGAAGGTG 1300
GGGTGGGGAG AGCAGCTGGA CTGGGATGTA AGCCATAGCA GGACTCCACG 1350
AGTTGTCACT ATCATTTATC GAGCACCTAC TGGGTGTCCC CAGTGTCCTC 1400
AGATCTCCAT AACTGGGGAG CCAGGGGCAG CGACACGGTA GCTAGCCGTC 1450
GATTGGAGAA CTTTAAAATG AGGACTGAAT TAGCTCATAA ATGGAACACG 1500
GCGCTTAACT GTGAGGTTGG AGCTTAGAAT GTGAAGGGAG AATGAGGAAT 1550 | var(1522):[A:0.01]
GCGAGACTGG GACTGAGATG GAACCGGCGG TGGGGAGGGG GTGGGGGGAT 1600 | var(1575):[T:0.01]
GGAATTTGAA CCCCGGGAGA GGAAGATGGA ATTTTCTATG GAGGCCGACC 1650
TGGGGATGGG GAGATAAGAG AAGACCAGGA GGGAGTTAAA TAGGGAATGG 1700
GTTGGGGGCG GCTTGGTAAA TGTGCTGGGA TTAGGCTGTT GCAGATAATG 1750
CAACAAGGCT TGGAAGGCTA ACCTGGGGTG AGGCCGGGTT GGGGCCGGGC 1800
TGGGGGTGGG AGGAGTCCTC ACTGGCGGTT GATTGACAGT TTCTCCTTCC 1850
CCAGACTGGC CAATCACAGG CAGGAAGATG AAGGTTCTGT GGGCTGCGTT 1900 | Exon 2 | UTR
                              M   K  V  L   W  A  A  L 8
GCTGGTCACA TTCCTGGCAG GTATGGGGGC GGGGCTTGCT CGGTTCCCCC 1950
  L  V  T   F  L  A                                    14
CGCTCCTCCC CCTCTCATCC TCACCTCAAC CTCCTGGCCC CATTCAGGCA 2000 | var(1998):[A:0.10]
GACCCTGGGC CCCCTCTTCT GAGGCTTCTG TGCTGCTTCC TGGCTCTGAA 2050
CAGCGATTTG ACGCTCTCTG GGCCTCGGTT TCCCCCATCC TTGAGATAGG 2100
AGTTAGAAGT TGTTTTGTTG TTGTTGTTTG TTGTTGTTGT TTTGTTTTTT 2150 | REPEAT
TGAGATGAAG TCTCGCTCTG TCGCCCAGGC TGGAGTGCAG TGGCGGGATC 2200
TCGGCTCACT GCAAGCTCCG CCTCCCAGGT CCACGCCATT CTCCTGCCTC 2250
AGCCTCCCAA GTAGCTGGGA CTACAGGCAC ATGCCACCAC ACCCGACTAA 2300
CTTTTTTGTA TTTTCAGTAG AGACGGGGTT TCACCATGTT GGCCAGGCTG 2350
GTCTGGAACT CCTGACCTCA GGTGATCTGC CCGTTTCGAT CTCCCAAAGT 2400
GCTGGGATTA CAGGCGTGAG CCACCGCACC TGGCTGGGAG TTAGAGGTTT 2450 | var(2440):[A:0.21]
CTAATGCATT GCAGGCAGAT AGTGAATACC AGACACGGGG CAGCTGTGAT 2500
CTTTATTCTC CATCACCCCC ACACAGCCCT GCCTGGGGCA CACAAGGACA 2550
CTCAATACAT GCTTTTCCGC TGGGCGCGGT GGCTCACCCC TGTAATCCCA 2600 | REPEAT
GCACTTTGGG AGGCCAAGGT GGGAGGATCA CTTGAGCCCA GGAGTTCAAC 2650
ACCAGCCTGG GCAACATAGT GAGACCCTGT CTCTACTAAA AATACAAAAA 2700
TTAGCCAGGC ATGGTGCCAC ACACCTGTGC TCTCAGCTAC TCAGGAGGCT 2750
GAGGCAGGAG GATCGCTTGA GCCCAGAAGG TCAAGGTTGC AGTGAACCAT 2800
GTTCAGGCCG CTGCACTCCA GCCTGGGTGA CAGAGCAAGA CCCTGTTTAT 2850
AAATACATAA TGCTTTCCAA GTGATTAAAC CGACTCCCCC CTCACCCTGC 2900
CCACCATGGC TCCAAAGAAG CATTTGTGGA GCACCTTCTG TGTGCCCCTA 2950 | var(2907):[G:0.01]
GGTACTAGAT GCCTGGACGG GGTCAGAAGG ACCCTGACCC ACCTTGAACT 3000
TGTTCCACAC AGGATGCCAG GCCAAGGTGG AGCAAGCGGT GGAGACAGAG 3050 | Exon 3
             G  C  Q   A  K  V   E  Q  A  V   E  T  E  27
CCGGAGCCCG AGCTGCGCCA GCAGACCGAG TGGCAGAGCG GCCAGCGCTG 3100
 P  E  P   E  L  R  Q   Q  T  E   W  Q  S   G  Q  R  W 44
GGAACTGGCA CTGGGTCGCT TTTGGGATTA CCTGCGCTGG GTGCAGACAC 3150 | var(3106):[C:0.01]
  E  L  A   L  G  R   F  W  D  Y   L  R  W   V  Q  T   60
TGTCTGAGCA GGTGCAGGAG GAGCTGCTCA GCTCCCAGGT CACCCAGGAA 3200
L  S  E  Q   V  Q  E   E  L  L   S  S  Q  V   T  Q  E  77
CTGAGGTGAG TGTCCCCATC CTGGCCCTTG ACCCTCCTGG TGGGCGGCTA 3250
 L  R                                                  79
TACCTCCCCA GGTCCAGGTT TCATTCTGCC CCTGTCGCTA AGTCTTGGGG 3300
GGCCTGGGTC TCTGCTGGTT CTAGCTTCCT CTTCCCATTT CTGACTCCTG 3350
GCTTTAGCTC TCTGGAATTC TCTCTCTCAG CTTTGTCTCT CTCTCTTCCC 3400
TTCTGACTCA GTCTCTCACA CTCGTCCTGG CTCTGTCTCT GTCCTTCCCT 3450
AGCTCTTTTA TATAGAGACA GAGAGATGGG GTCTCACTGT GTTGCCCAGG 3500 | REPEAT
CTGGTCTTGA ACTTCTGGGC TCAAGCGATC CTCCCGCCTC GGCCTCCCAA 3550
AGTGCTGGGA TTAGAGGCAT GAGCCACCTT GCCCGGCCTC CTAGCTCCTT 3600
CTTCGTCTCT GCCTCTGCCC TCTGCATCTG CTCTCTGCAT CTGTCTCTGT 3650
CTCCTTCTCT CGGCCTCTGC CCCGTTCCTT CTCTCCCTCT TGGGTCTCTC 3700 | var(3673):[G:0.01]
TGGCTCATCC CCATCTCGCC CGCCCCATCC CAGCCCTTCT CCCCGCCTCC 3750 | var(3701):[CT:0.01]
CACTGTGCGA CACCCTCCCG CCCTCTCGGC CGCAGGGCGC TGATGGACGA 3800 | Exon 4
                                        A   L  M  D  E 84
GACCATGAAG GAGTTGAAGG CCTACAAATC GGAACTGGAG GAACAACTGA 3850
  T  M  K   E  L  K   A  Y  K  S   E  L  E   E  Q  L   100
CCCCGGTGGC GGAGGAGACG CGGGCACGGC TGTCCAAGGA GCTGCAGGCG 3900
T  P  V  A   E  E  T   R  A  R   L  S  K  E   L  Q  A  117
GCGCAGGCCC GGCTGGGCGC GGACATGGAG GACGTGTGCG GCCGCCTGGT 3950 | var(3937):[C:0.14]
 A  Q  A   R  L  G  A   D  M  E   D  V  C   G  R  L  V 134
GCAGTACCGC GGCGAGGTGC AGGCCATGCT CGGCCAGAGC ACCGAGGAGC 4000
  Q  Y  R   G  E  V   Q  A  M  L   G  Q  S   T  E  E   150
TGCGGGTGCG CCTCGCCTCC CACCTGCGCA AGCTGCGTAA GCGGCTCCTC 4050 | var(4036):[T:0.01]
L  R  V  R   L  A  S   H  L  R   K  L  R  K   R  L  L  167
CGCGATGCCG ATGACCTGCA GAAGCGCCTG GCAGTGTACC AGGCCGGGGC 4100 | var(4075):[T:0.07]
 R  D  A   D  D  L  Q   K  R  L   A  V  Y   Q  A  G  A 184
CCGCGAGGGC GCCGAGCGCG GCCTCAGCGC CATCCGCGAG CGCCTGGGGC 4150
  R  E  G   A  E  R   G  L  S  A   I  R  E   R  L  G   200
CCCTGGTGGA ACAGGGCCGC GTGCGGGCCG CCACTGTGGG CTCCCTGGCC 4200
P  L  V  E   Q  G  R   V  R  A   A  T  V  G   S  L  A  217
GGCCAGCCGC TACAGGAGCG GGCCCAGGCC TGGGGCGAGC GGCTGCGCGC 4250
 G  Q  P   L  Q  E  R   A  Q  A   W  G  E   R  L  R  A 234
GCGGATGGAG GAGATGGGCA GCCGGACCCG CGACCGCCTG GACGAGGTGA 4300
  R  M  E   E  M  G   S  R  T  R   D  R  L   D  E  V   250
AGGAGCAGGT GGCGGAGGTG CGCGCCAAGC TGGAGGAGCA GGCCCAGCAG 4350
K  E  Q  V   A  E  V   R  A  K   L  E  E  Q   A  Q  Q  267
ATACGCCTGC AGGCCGAGGC CTTCCAGGCC CGCCTCAAGA GCTGGTTCGA 4400
 I  R  L   Q  A  E  A   F  Q  A   R  L  K   S  W  F  E 284
GCCCCTGGTG GAAGACATGC AGCGCCAGTG GGCCGGGCTG GTGGAGAAGG 4450
  P  L  V   E  D  M   Q  R  Q  W   A  G  L   V  E  K   300
TGCAGGCTGC CGTGGGCACC AGCGCCGCCC CTGTGCCCAG CGACAATCAC 4500
V  Q  A  A   V  G  T   S  A  A   P  V  P  S   D  N  H  317
TGAACGCCGA AGCCTGCAGC CATGCGACCC CACGCCACCC CGTGCCTCCT 4550 | UTR
                                                       317
GCCTCCGCGC AGCCTGCAGC GGGAGACCCT GTCCCCGCCC CAGCCGTCCT 4600
CCTGGGGTGG ACCCTAGTTT AATAAAGATT CACCAAGTTT CACGC
ATCTG 4650
CTGGCCTCCC CCTGTGATTT CCTCTAAGCC CCAGCCTCAG TTTCTCTTTC 4700
TGCCCACATA CTGGCCACAC AATTCTCAGC CCCCTCCTCT CCATCTGTGT 4750
CTGTGTGTAT CTTTCTCTCT GCCCTTTTTT TTTTTTTTAG ACGGAGTCTG 4800 | REPEAT
GCTCTGTCAC CCAGGCTAGA GTGCAGTGGC ACGATCTTGG CTCACTGCAA 4850
CCTCTGCCTC TTGGGTTCAA GCGATTCTGC TGCCTCAGTA GCTGGGATTA 4900
CAGGCTCACA CCACCACACC CGGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGACG 4950
AGCTTTCACC ATGTTGGCCA GGCAGGTCTC AAACTCCTGA CCAAGTGATC 5000
CACCCGCCGG CCTCCCAAAG TGCTGAGATT ACAGGCCTGA GCCACCATGC 5050
CCGGCCTCTG CCCCTCTTTC TTTTTTAGGG GGCAGGGAAA GGTCTCACCC 5100 | REPEAT
TGTCACCCGC CATCACAGCT CACTGCAGCC TCCACCTCCT GGACTCAAGT 5150
GATAAGTGAT CCTCCCGCCT CAGCCTTTCC AGTAGCTGAG ACTACAGGCG 5200
CATACCACTA GGATTAATTT GGGGGGGGGG TGGTGTGTGT GGAGATGGGG 5250 | var(5229):[GG:0.03] | var(5230):[:0.13]
TCTGGCTTTG TTGGCCAGGC TGATGTGGAA TTCCTGGGCT CAAGCGATAC 5300
TCCCACCTTG GCCTCCTGAG TAGCTGAGAC TACTGGCTAG CACCACCACA 5350
CCCAGCTTTT TATTATTATT TGTAGAGACA AGGTCTCAAT ATGTTGCCCA 5400 | var(5361):[C:0.06]
GGCTAGTCTC AAACCCCTGG GCTCAAGAGA TCCTCCGCCA TCGGCCTCCC 5450
AAAGTGCTGG GATTCCAGGC ATGGGCTCCG AGCGGCCTGC C