APOA5 Color FASTA
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*Display courtesy of GeneSNPs
CTACTCAGTT TGATTCAGCT ATGACCCTTT CAGACATGGT CCAAATGAGA 50
GTCACGCCAG GCAAACTTCT ATCATAAACA TCTATTTCAT TTGAGCCAGA 100 | Exon 1 | UTR
AGTCTAGGCT TCAACTTGGG AACCCAGAGG GAGGGGCTGG AGATGGGGAG 150
AGCACACAGT ATGCTCCCCA GAGGGTTTAA GGAGCTCCCA CAGTTGGGAG 200
GGTTCAGTCC CTTATTTAGG TGTAGAGCTA TGTCAGGAAA CATGGGCTCT 250
GCCCTCTCCT ATCACAGCCC ACACCTTTCG TACCCACCAG CATCAGAGCC 300
AGCAGGGATA TTCACACACC ATCACATGTT CTCCCCATGA TATTCTCTTT 350
CTCCCTTCTA TTCCCCTGAT AGCTGCCATG GCAGCCCTGG GGAGACAAGT 400
GCTCCTCTCT GTGGACCAGC TGTAGCAGTG GCCACCAGGC AGCCAGAAGT 450 | var(434):[G:0.05]
GACTAGAGCC AAACTCCAGG ATGTAGTGGC ACAGGCTTCC AGCATCACGG 500
CAAACAGGCT TGCAGATAAT CACCCACATG CATGGTGCCT CTCCCTCCCT 550 | var(537):[:0.95]
ACTCCCTCAC CCTTGAATGG AGTAACTCAT GAGCATTCCC AAATGAGCAC 600
TGGGAGGCTG GGTTTGCAAA GCCTGGTGAA TGTAATGCAT CCAGATTGGG 650 | var(637):[A:0.01]
GAGTCGCAGG AGGCTGGATA TGCAGGAGAC AGCAGCCCCT TTGGTGGCCT 700 | var(670):[G:0.04]
CCCTGTCCTG CACAGGACCT TCCACCCTCC ACCCAACAGG CCACTTTCAA 750
GGACTGAACC ATGCTAGAGG CTCAGAGCCA AGGCTCCCCA GACAAGGAGC 800 | var(752):[A:0.04] | var(797):[A:0.11]
TGGGAATGGG CCTGGGCAGG TAGATCCT
CA GGGGTCCCCC AGATGGCTGT 850
                              M   A  S  M   A  A  V  L 8
GGCCCTGGTC ATGAAGGCTG TGAGTGATGT CTTCCCACAG GTCATCCAGA 900
  T  W  A   L  A  L   L  S  A  F   S  A  T   Q  A  R   24
CGGGCCTGCA GCTTGCTCAG AACCTTGCCA CTGTCTGTTT GTTGAAACTC 950
K  G  F  W   D  Y  F   S  Q  T   S  G  D  K   G  R  V  41
TGGGGCGAAG GCACTGTGGC CTGGTGGAGG TGGCGCCAGC TGCTGCTGGA 1000
 E  Q  I   H  Q  Q  K   M  A  R   E  P  A   T  L  K  D 58
CCTCCTCAGT CTCCTGGTCG ATGGCGCGAG TGAAGGCAGC TATCTGCAGG 1050
  S  L  E   Q  D  L   N  N  M  N   K  F  L   E  K  L   74
TAGGTGTCCT GGCGGAAAGC CTGAAGTCGC TGGCGCACCT CCTCGGAGAG 1100
R  P  L  S   G  S  E   A  P  R   L  P  Q  D   P  V  G  91
CATCTGGGGG TCCGGGCCGG CCCCTTCCTC AGTCCCAGTG CCTGCAAAGG 1150
 M  R  R   Q  L  Q  E   E  L  E   E  V  K   A  R  L  Q 108
CTCTGCTGAG CTCTTCGCGC AGCTGGTCCA GGTTCTGCTG GATGCGTGCG 1200
  P  Y  M   A  E  A   H  E  L  V   G  W  N   L  E  G   124
TGCAGGGCCT TGGCCTTGAG CGTGAGCTTC CGGGAGAGCA CCTGCACGCA 1250
L  R  Q  Q   L  K  P   Y  T  M   D  L  M  E   Q  V  A  141
GCGACTGAGG CGCGCGGGGC TGGCGGGGGC GTGCGGAGCC ACACTGCGGT 1300
 L  R  V   Q  E  L  Q   E  Q  L   R  V  V   G  E  D  T 158
GCAGCTCCTG CACGTGGCGC CCGATGCCGC TCACCAGGCT CTCGGCGTAT 1350
  K  A  Q   L  L  G   G  V  D  E   A  W  A   L  L  Q   174
GGGTGGAAGA GCTCTTTGAA GCGGCCGGTG TGGTGCACCA CGCGGCTCTG 1400
G  L  Q  S   R  V  V   H  H  T   G  R  F  K   E  L  F  191
CAGTCCCTGC AGCAAAGCCC AAGCCTCGTC CACGCCCCCC AGCAACTGGG 1450
 H  P  Y   A  E  S  L   V  S  G   I  G  R   H  V  Q  E 208
CCTTGGTGTC TTCCCCCACC ACGCGCAACT GCTCCTGCAG CTCCTGCACG 1500 | var(1472):[T:0.05]
  L  H  R   S  V  A   P  H  A  P   A  S  P   A  R  L   224
CGCAGGGCCA CCTGCTCCAT CAGATCCATC GTGTAGGGCT TCAGTTGCTG 1550
S  R  C  V   Q  V  L   S  R  K   L  T  L  K   A  K  A  241
CCGCAAGCCC TCCAAATTCC AGCCCACCAG CTCGTGCGCC TCTGCCATGT 1600
 L  H  A   R  I  Q  Q   N  L  D   Q  L  R   E  E  L  S 258
AGGGCTGGAG GCGAGCCTTC ACCTCCTCCA ACTCCTCCTG CAGCTGCCGC 1650
  R  A  F   A  G  T   G  T  E  E   G  A  G   P  D  P   274
CGCATGCCCA CCGGGTCCTG TGGGAGCCGA GGAGCCTCGC TCCCACTCAG 1700
Q  M  L  S   E  E  V   R  Q  R   L  Q  A  F   R  Q  D  291
AGGCCTCAGC TTTTCCAGGA ACTTGTTCAT ATTGTTGAGG TCTTGCTCAA 1750
 T  Y  L   Q  I  A  A   F  T  R   A  I  D   Q  E  T  E 308
GGCTGTCTTT CAGGGTCCTG GAGAAGGGGA CAGATATCCA GGCCGTCAGA 1800
  E  V  Q   Q  Q                                       313
CTGCTAGCCC CCATCATCTC CTTTGTCCCC AAGTCATCGC GCACTGATCC 1850 | var(1810):[T:0.04]
TCTGGGGGAA CCAAGGACGC AGGGCGTTGG CCCCAGGGTC GAGGGCTCTT 1900
GTCCTAGCCC TGGCCAGTAA CAACTCACGC ACGAAGCACA AACACATTGC 1950
CCATACAAAT CCAGACCTAC AACACTCTCC AAAGAAACAT AGATGCGCCA 2000
CATCATCCTT TGATTCTGGG GACTGCAGCG GGCGTCCTCC CGATTGATCC 2050
CAGGTCCCGC GCCTCAGTGA GCAAGGGGGC AACAGCTACG GAGTTGTCAA 2100
GGCGGGGGCT GCAGGCAGAG GGCGCTAAAG AGCCCAGGAT GGCCGGGATC 2150
TGCAGACAGA GCTAGCACCG CTCCTTTCCT CTGTCCCAGC AGCGGCCACA 2200
GAGGTTGAGG CAGCAGAGGC AGGTCATCAT GGCATGGCCC AGCTGTCTCC 2250
TCCCTTCGCC TACACCCCTT CCCCTGGGCA CTCACGCGGG CTCGCGAGCC 2300 | Exon 2
                                      L  A   P  P  P   318
ATCTTCTGCT GATGGATCTG CTCCACCCTG CCTTTGTCCC CGCTGGTCTG 2350 | var(2315):[T:0.15]
P  G  H  S   A  F  A   P  E  F   Q  Q  T  D   S  G  K  335
GCTGAAGTAG TCCCAGAAGC CTTTCCGTGC CTGGGTGGCC GAAAACGCTG 2400 | var(2391):[C:0.06]
 V  L  S   K  L  Q  A   R  L  D   D  L  W   E  D  I    351
TGGAGAGGGA CTAGGTAATC AGGGCCTGGG CTCTCCTCCC CCAGGGTGGA 2450 | var(2425):[T:0.01]
CAGGGCCCTC TGGCCAGCCT CCACCCACAC CCCCACGTTG AAGTCAGGGT 2500 | var(2457):[A:0.04]
CGGAGACCCA CCTGAAAGAA GAGCCAGAGC CCAGGTGAGC ACGGCAGCCA 2550 | Exon 3
              T  H  S   L  H  D   Q  G  H   S  H  L  G 364
TGCTTGCCAT TATCTGCTCT GAGAAGACAG GTGGAGGGAG GCCTGGTTAG 2600 | UTR | var(2563):[C:0.09]
  D  P                                                 366
GGGAAGAAGG AGACGAAGGG ACATGGCGCA GGGGACTTGC CCAGGGGGCC 2650
TCTGCAGGGG CAACTGCCCG AAATCCTGTT ACCCCTTCCT TGGGCTGGGG 2700
AGCACAGAGC TGTTGGGGCT CAAGAGGACT GACCTAGGTG AGTCAAGGAG 2750
GCTAGGGTGT CTTCCTCAGA CATGGGAAGA GGGCGTGCTC TTGCTACCTC 2800 | var(2769):[A:0.02]
AGTCACATAG CAGGGAGCGT GGTGCTCTAA CCCCTTCGCA AAGGTCCCAG 2850
ACCCCAGGAA CAGTTCTCTA GGCCACTTCT ACCACCTCTC CCCTGCCCAC 2900
CTGTCTCCCT CCCTCCCATT TCATGGTGGA AAAACTGAGC CATAATGAGG 2950
GCGAAGAGGC AACTCTGCCA AAATGTTCCA AGAGGACGTC TTAGGGGCCA 3000
CCCCAGGCTC TCCCCTGAGG CCACCTGCAA TGCCCTCCCT TAGGACTGTG 3050
ACCCCCATCC CTCTGCCCCA GCTGCTCACC TGCTCACGTC TGGGCACAGA 3100 | var(3099):[A:0.01]
GAGCAGACAT TCTGCTTTAT ACTCCAGGGC CCTGAGCCTC TGGCACCAAT 3150
TGCTCTGAGT AAATACCACG TGGAAGTTCA AAAGAAGTTG ACCTCAGCTG 3200
CCTCCCAGCA CTCACCTCCT GCCCTTTCCC TGGCACCCAG AGGGTTAATG 3250
AGTGCCCTGG TATCAGGGGC TGCCCCAGTA GAGAAGTGCT TCCCAGGAGC 3300
TTTACGGGGG ATGGGGCTGA ACTCCTCACC CAGTTTCTCC CAAACCCCAT 3350
GACCTTTAAC CTTCCCACTG ACCTGCTGGC TGGCCCACCA ACAGAGAAGA 3400
ACCTGTTTGT CTGCCAAGGG CCCCTCTCTT ACACAACTAC CCAGAGTCAC 3450
TGTGTCCCAG CCGGCAAGAT GGACAGTGTT CACCTACCAG CCAGAACCCG 3500
AGCAGCCCCT GAAAGCTTCA CTACAGGTTC CGCAGGCATC CTCAGCCAGC 3550
ATTCATAGGG TTAAAGACCA ACCACATCCC TCTTTATGAA ACAATCCTGG 3600 | var(3580):[T:0.06]
AACAAGCAAG GGAAGCCAGG CAGGGTGAAG ATGAGATGGC AAGAGGCATC 3650
TGGGCCAGGG ACTCTGAGCC CCAGGAACTG GAGCGAAAGT AAGATTTGCC 3700 | var(3659):[A:0.09] | var(3691):[G:0.09]
CCATGAGGAA AAGCTGAACT CCACTCGCAG GGCCTCTGAG GAGAGCAAGC 3750 | var(3710):[G:0.01] | var(3727):[A:0.01]
CCAAATGCTC AGATCTTCTC TGATGACACA CCCACTCCGT CTACAGTACT 3800
CATACACACG TTCACAAGCT CCCGATTCTT GGTCCTAAAT GCATCTTGAA 3850 | REPEAT | var(3835):[T:0.12]
TCAATCCCCT CTCCTCCATT TCCACTACCA TCATTGCACC AGTTGTCTGT 3900
CACCTTGATT GCATTCATAG CCTCCAACAG GTCTTTCTAC CACACTCCTG 3950 | var(3950):[A:0.10]
C
CCATTTAAT TCATCCTCCA CTGTGGCTCA TCCTGACTCA TTTCCAGTCT 4000
CATCTGCTGC CACATAAAAC CACAGCATTC CCTGAGCCTT TATACAGGCT 4050 | var(4024):[G:0.36]
TCCCTCTGCT TGAAATAGCC TATCCCCTGG TGAATATATA TTCATTTTTT 4100
AGAGTTAGTT TGTATTAGTT AGAATTAGAC TTGGCTGCAA GGGACATATA 4150
TATGT