Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz hz 003102 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003511 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003548 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003586 A 0.23 0.55 0.38 G 0.77 0.45 0.62 0.35 0.50 0.47 003604 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003648 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003680 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003944 C 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.13 004218 C 0.42 0.39 0.40 G 0.58 0.61 0.60 0.49 0.47 0.48 004474 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 005085 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005120 T 0.33 0.07 0.21 C 0.67 0.93 0.79 0.44 0.14 0.33 005206 T 0.24 0.00 0.13 C 0.76 1.00 0.87 0.36 0.00 0.22 005609 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005693 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 005743 T 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 005821 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 005859 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 006149 G 0.22 0.55 0.40 A 0.78 0.45 0.60 0.35 0.50 0.48 006201 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006240 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 007843 T 0.00 0.29 0.17 C 1.00 0.71 0.83 0.00 0.41 0.29 008581 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008683 T 0.33 0.54 0.43 C 0.67 0.46 0.57 0.44 0.50 0.49 008824 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008858 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008906 T 0.15 0.09 0.12 A 0.85 0.91 0.88 0.26 0.16 0.21 008937 T 0.20 0.09 0.14 C 0.80 0.91 0.86 0.31 0.16 0.24 009557 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009676 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009983 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010091 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 010293 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 010414 + 0.35 0.37 0.36 - 0.65 0.63 0.64 0.46 0.47 0.46 010474 A 0.35 0.37 0.36 G 0.65 0.63 0.64 0.46 0.47 0.46 010695 C 0.37 0.39 0.38 T 0.63 0.61 0.62 0.47 0.47 0.47 010876 T 0.36 0.39 0.38 C 0.64 0.61 0.62 0.46 0.47 0.47 011092 G 0.40 0.37 0.38 A 0.60 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 011121 A 0.15 0.37 0.26 C 0.85 0.63 0.74 0.25 0.47 0.38 011163 A 0.40 0.37 0.38 G 0.60 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 011194 G 0.40 0.37 0.38 C 0.60 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 011299 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011334 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011379 G 0.34 0.50 0.41 A 0.66 0.50 0.59 0.45 0.50 0.48 011582 C 0.39 0.25 0.32 A 0.61 0.75 0.68 0.47 0.38 0.44 011636 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011973 G 0.39 0.26 0.33 A 0.61 0.74 0.67 0.48 0.39 0.44 012118 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012202 C 0.41 0.39 0.40 T 0.59 0.61 0.60 0.48 0.47 0.48 012381 C 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 012443 C 0.40 0.41 0.40 T 0.60 0.59 0.60 0.48 0.48 0.48 012619 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 012626 G 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 012861 C 0.39 0.37 0.38 A 0.61 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 012946 G 0.28 0.66 0.47 A 0.72 0.34 0.53 0.41 0.45 0.50 012990 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 013813 + 0.39 0.37 0.38 - 0.61 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 014171 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014644 A 0.35 0.33 0.34 G 0.65 0.68 0.66 0.45 0.44 0.45 016419 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016497 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 016537 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016896 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016940 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 017064 T 0.25 0.00 0.13 C 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 017153 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017181 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017448 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 017460 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 017505 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017652 A 0.57 0.39 0.48 G 0.43 0.61 0.52 0.49 0.48 0.50 018342 G 0.36 0.38 0.37 A 0.64 0.62 0.63 0.46 0.47 0.47 019130 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019372 T 0.13 0.03 0.08 C 0.87 0.97 0.92 0.23 0.05 0.15 019390 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019488 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 019550 T 0.18 0.00 0.09 C 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.17 019756 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 019827 A 0.09 0.03 0.06 G 0.91 0.97 0.94 0.17 0.05 0.11 020189 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020263 C 0.52 0.37 0.45 T 0.48 0.63 0.55 0.50 0.47 0.49 020616 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020830 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020898 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 021095 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021550 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021681 C 0.56 0.37 0.47 T 0.44 0.63 0.53 0.49 0.47 0.50 022135 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022204 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022271 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 022287 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 022412 G 0.36 0.60 0.49 A 0.64 0.40 0.51 0.46 0.48 0.50 022582 A 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 022595 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022632 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 010414: G 022287: T