ANGPTL3 Color FASTA

The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.

*Display courtesy of GeneSNPs

TGTAACTATT ATACCCAAAA CCCTTAATCC TAAGTCATCA AAAGGAAGAG 50 CCTCTATTTT ACACAATGAA GAGGCATTTC TAAGAATAGA AATTTAGGGA 100 CGAGCACAGT GGCTTACTCC TTTAATATCA GCACTTTGAG AGGCTGATAT 150 | REPEAT GGGAGGTTCA CTTGAAGTCA GGAGTTCAAG GTCAGCTTGG GCAACATAGT 200 GAAACACAGT CTCTACAAAA TATTTAAAAA TTAGCTGGGT GTGGTGGCAT 250 GCATCTATAG TCTCAGCTAC TTGGGAGACA GAGGGAGGAG GCTTGCTCGA 300 GCCCAGGAGT TCGTGGCTAT AGTGAGCTAT GATCATGCCA CTGCACTCCA 350 GCCTGGACAA CAGAGCAAGA CCCTGTCTCT AAAAAAGAAA AGAAATTTGG 400 | var(393):[C:0.01] AAATGGTTTA TTTTGTATTA ACAATTTATA ATTTACACTG AAATTTATTA 450 TGATAAAACT TTTCCCTGTG TTAAAAAGCT ATTAACTTTA TGAAAAATTT 500 CTTTTAGGTA AGGTTGATTA TATATACCCA CACACATACA CAGGTTAAAA 550 GTTAGTTTCA TGTGACATAA TAACTAGCAT TTTGAGCACT ACCTGTTTGC 600 | REPEAT CCAGCACTGT TCTAAGTGCT CTACATGTAT TATTGTTAAA TTATCATAAC 650 ACTATGAATT ATGTACTATA ATTACCCCAG CTTTACAGAT GAGGAGACTA 700 | var(686):[T:0.50] ATCCATGGGG AGGTTAAGTA ACTTGTCCAA GGCCAGACAG CTAGAGCCGG 750 CTTTTGGACC CACACCACAG TCTGACTCCA GCACCCATAT TCTTAACAAT 800 TTCACCATAT TAATATGTCA AGATTAAGCA GTTTTAAAGG ATGCTATTTT 850 CTCACAAATT TCTTAATATG AACACTCAAT AAGAATAATC ACTAATATAA 900 GCATTTAGTA TTTTTTTAAC ACTAAGTTGG AAGCATAGTG GAACATTTAT 950 TTTTAGAAAT ATTATTAATT GGCTGGGCTC ACGCTTGTAA TCGGCTGGGC 1000 | REPEAT TCATGCCTGT AAATTTTGGG AGGCCAAGGT AAAAGAATTG CTTGAGCCCA 1050 GTATTTCCAG ACCAGCATGG GCAATACATT AAGACATCAT CTTTAAAAAA 1100 AAAATGTTAT TAATCTCCTC TTTTTGTTAA ATGTATATTA TCAAAATTGT 1150 TACTAAGCTA ACAAACTTCA GAAAAACTTA TGATGGGCAA GCTGCTTGTG 1200 ACATTGAAGG TATTTAAGAT TCAATTCTAG TTTGGTCCTA GATGACCACA 1250 TATCCATTGT TCCTTCAACG AGCACATGGT AAAGAGCCTA GAACACAGAG 1300 ACACAGAACA CAGTGGAGAA AAGGGAGTGA AATGTCTTTA ATGACACTTA 1350 CTATATATGG GATTTTGTGA CAATATACAA GGATGGTTAA GACATATAAG 1400 GTGATGCAAA AAAACATATT AACAATTATA GTGACAAAAA ATGAGGAGCA 1450 TATAATTATA CATTGATTTA TACAGAGTAC CAGAGGAACA CAGCATTGAG 1500 AGCCGTAACA CCACCTGAGG GAGTGGAGAA AGGCTTCAGA GAGAAAGTGT 1550 TTTTTGGAAT GGATCACTGT TTCCAAAAGA ACTAAAGTAC AGTTTGAGAA 1600 ATGCATACTT AATTCATTAC TTTTTTCCCC TCAACTTTAA TAATAAATTT 1650 ACCCAACAAA AAAGTTTATT TTTGACTTGT AAATCTCTTA AAATCATAAA 1700 AAAGTAAAAT TAGCTTTTAA AAACAGGTAG TCACCATAGC ATTGAATGTG 1750 TAGTTTATAA TACAGCAAAG TTAAATACAA TTTCAAATTA CCTATTAAGT 1800 TAGTTGCTCA TTTCTTTGAT TTCATTTAGC ATTGATCTAA CTCAATGTGG 1850 AAGAAGGTTA CATTCGTGCA AGTTAACACG GCTTAATGAT TAACTATGTT 1900 CACCTACCAA CCTTACCTTT TCTGGGCAAA TATTGGTATA TATAGAGTTA 1950 AGAAGTCTAG GTCTGCTTCC AGAAGAAAAC AGTTCCACGT TGCTTGAAAT 2000 | var(1957):[T:0.09] TGAAAATCAA GATAAAAATG TTCACAATTA AGCTCCTTCT TTTTATTGTT 2050 | Exon 1 | UTR M F T I K L L L F I V 11 CCTCTAGTTA TTTCCTCCAG AATTGATCAA GACAATTCAT CATTTGATTC 2100 P L V I S S R I D Q D N S S F D S 28 TCTATCTCCA GAGCCAAAAT CAAGATTTGC TATGTTAGAC GATGTAAAAA 2150 L S P E P K S R F A M L D D V K 44 TTTTAGCCAA TGGCCTCCTT CAGTTGGGAC ATGGTCTTAA AGACTTTGTC 2200 I L A N G L L Q L G H G L K D F V 61 CATAAGACGA AGGGCCAAAT TAATGACATA TTTCAAAAAC TCAACATATT 2250 H K T K G Q I N D I F Q K L N I F 78 TGATCAGTCT TTTTATGATC TATCGCTGCA AACCAGTGAA ATCAAAGAAG 2300 D Q S F Y D L S L Q T S E I K E 94 AAGAAAAGGA ACTGAGAAGA ACTACATATA AACTACAAGT CAAAAATGAA 2350 E E K E L R R T T Y K L Q V K N E 111 GAGGTAAAGA ATATGTCACT TGAACTCAAC TCAAAACTTG AAAGCCTCCT 2400 E V K N M S L E L N S K L E S L L 128 AGAAGAAAAA ATTCTACTTC AACAAAAAGT GAAATATTTA GAAGAGCAAC 2450 E E K I L L Q Q K V K Y L E E Q 144 TAACTAACTT AATTCAAAAT CAACCTGAAA CTCCAGAACA CCCAGAAGTA 2500 L T N L I Q N Q P E T P E H P E V 161 ACTTCACTTA AAGTAAGTAG AAAATAAAGA GGGTTCATGT TTATGTTTTC 2550 T S L K 165 AATGTGGATC TTTTAAAAAA AATATTTCTA AGGCATGCCA TTTGAAATAC 2600 TTTGTTGCAT TGTTGAAATA CTTTTTTTTC CAAGAAAAAT AATCTCCAGA 2650 | var(2610):[C:0.09] AAATAAAATT TCCTATTATA ATTTCAAGTT AGTTTTTTGT TTCCCTAATG 2700 TTATATATGA AAACACTGAA AATTTGCATT TTATATGAAA ATTACAAATC 2750 GGTTAAATTA TACAATCTAG AACACTATGT CATTACACTA TTGTAAATTA 2800 CTGAAGGTAA GTAAAAAGTT AAAAAAAATT TAAAACTATT CTCCAGTGTT 2850 TAAAACAGAT TAAATAATAC AGTAAATGGA AAAGATTTAT TCATATGAAA 2900 ATATGCTGGG CTTTTTCTTT TAATTGAAGT TCAGAAAATC AAATTTTAGA 2950 GATAGTACAA TTTAAATAAA ATGTTAAGGA CAAAAATATG TGCTATTTGA 3000 | var(2953):[C:0.01] AAGAAGCATA CAAGGGGAAG GAATTGCCAA TATTCATTTT TCAAATCCAT 3050 TATTAGTTTA AAAATTTAGA TTATGATAGT GTTACAGGAA ATTAATAGAA 3100 AAGAAAGAGG AAAGCAACTT ATAACCAACC TACTCTCTAT ATCCAGACTT 3150 | Exon 2 T 166 TTGTAGAAAA ACAAGATAAT AGCATCAAAG ACCTTCTCCA GACCGTGGAA 3200 F V E K Q D N S I K D L L Q T V E 183 GACCAATATA AACAATTAAA CCAACAGCAT AGTCAAATAA AAGAAATAGA 3250 D Q Y K Q L N Q Q H S Q I K E I E 200 AAATCAGGTA AGTCAGTATT TTAATGGTAT GTCCCATCTT TCACACAGGT 3300 N Q 202 CTGTAAAAAC ACTGAATCCT AAAATTATTT ACAAGCTTTA ACTGGATCAT 3350 GAGTAAAATT ATCACATCAG CATAACTGTT AAAATTGCAG GCTCTGAAGC 3400 | REPEAT TAATAAACTA CCTGCATTTA AACCATGGCT CTAAAACTTT GTGTGACCTT 3450 GAATAAATTA CTTCACCCCT TTATCTCTCA GTTTCCTCAC ATATACTACA 3500 AAGATAATAA CAGAACTTAT AGGATTATTG TAAGAAAAAA AATTAATTCA 3550 | REPEAT TAGCAGCCAA TGTCATCTTA CTAAAATTCA AATTAGATCA TGTTTCTCTT 3600 TGCTCAAAAC CACACAATAG CTTTCCATTT CACTCATATT GGCTCTTTAG 3650 ACCAAGATTA CCCAACCCTT CGTCATCTCA CTGACTTCAC CTCCTCTACT 3700 CTAGTTATTC TGACCGCTTT ACCAGTATTC AAACACATCA AACATACTGC 3750 CACCTCAAAG CCTTTGCCCT TGTTGTTTCC TCTAACTGGA ACGCTCTTCT 3800 GCCCTGGTAT CTACGTGGCC CACTCTCTGA TTTCCCTTAG GGTCGTTATC 3850 AAACAAAAAA TTCCCAATGA AGACTTACAA GGTCACTTAA CCAAAAATCA 3900 CAACCGCCTG GTCCCATCCC TGAAAACTTC TACTTCCTTA GCTACTTTTC 3950 TCCTGCACAC TCACCTTTAT TTAACATAAC ATAAATTTTA GTTATTTATC 4000 TCTTCTATTC CTGCACTAAA ATGTAAGCTC TGTGAATACA GGGATTTTTT 4050 CCATTATCTT CATATTTTCC ATTATTTGTA TATACTCCAG AATATAGAAT 4100 ACTGTATGGC ACACAGTAGG CATTTCTGTT GAATTAATAA ATGTAATGTC 4150 ATATTCACAC AGAAGCGTGT GCTATGATTA TTATTACTTG GATTACTAGA 4200 AATAGTGTGC CTCATAATTA AAGGTCAACA TTCAACAATG TAATTAATCT 4250 ACAATGTAAA CATCTGGTGA AGTGACAGAG GGAAGCACTT GTTTAGAAAA 4300 AAGCTATGTC AGAATCCATG TATTCTAATA TGCAGTACAA TAGTTTAAAA 4350 ATATTAATAA TACTCTCAAA CAGCTATTCA AGAGGATTCA AAAAACATAA 4400 TATAAACTCA GAGAAACTGG TAAACAAAAT CATTTTCAAG AGATATAAAA 4450 CAAATATTAT TACCAATTTC CACTAAACAA ACATAATGTT AGTAGTGCTG 4500 CTAAAAGGTT TTTTATCAAC TACTTTTGGT TTCCATACTT TCCTTCTTAT 4550 GATGTTATTA TTCTAAATTC TTTTCAATTA TATCTTTTAC TATGATTAAA 4600 TGAACCTGCT CCCCAAAGCA AAATGTTACT ATAGTAATAT ACATTGTGTC 4650 TAAAAATAAA AATGTGTGAA GAAACCAAAA CAATGAATTT CTGAGTTGGA 4700 | REPEAT AGAAGAGTTA GATCATTTAA CTTTCTCATA TTTAAATTAA AAAAACAAAA 4750 CTCTAAAAAT TTAAGTAACT TTAAGATCAC ATAGTTACTT AGTAGAAAAG 4800 AGTAATACCC AGCAAGCAAA CTTTACAATA GATCCTTTTA AATAAGGTCC 4850 TAGGAAATAT CATTCATGCC AGCATCAAAA AACTAACACT AATAATGCAA 4900 GATATTATAT ATTCTGCTTT TCTTACTGTC AATGAGAAAA ACTATCATTC 4950 AATAAATTGC AAACCCAACA CACTTAAATA AAAATAAAAT GTTACTGCTA 5000 AACTAACGAT AAACTACTGA ATATATAGAA AGTAAGCAAA CAAACTTGCC 5050 AACCTGCCAA CATCTACAGA TATGTTTACA GGTCAAAAAT TATCAAATTA 5100 TCAAGAAAGC CTGGTTCAAA TTATGTATTA TGTCTTTATC ACAGGTCTGA 5150 AGATCAGTAA GACCTAAAAC TGAAAATTAT TAAACTTAAA ATCTGAACAG 5200 AATATCAAAT ATATTTTATT CATATAAATA AAAGAATACA TTACAATATT 5250 CTAAGCAAAG CAGTCTCTAC TTTTGGCCTT GCTCTGTTTT CCGACCAATG 5300 TCTGCTTTTT TGCCTTGCTT TATTTTTTTA TCTTATTAAA TAATGTCCCT 5350 GATTAAATAT TTTGAGAACA GGTAATCTGT ACAATCTGAA TAACACTGTT 5400 TATCTAAATA TCAAACACCG TTATAACATT ATGAACTGAA AGACAAACTG 5450 | var(5424):[C:0.02] TACTTCTGAC ATCCTTACTC AGATTTCCCC TAATTGTATA TTCAGTATCA 5500 TTTTAAAAAA CAGATTTATA TTCTTTTATC AGCTCAGAAG GACTAGTATT 5550 | Exon 3 L R R T S I 208 CAAGAACCCA CAGAAATTTC TCTATCTTCC AAGCCAAGAG CACCAAGAAC 5600 Q E P T E I S L S S K P R A P R T 225 TACTCCCTTT CTTCAGTTGA ATGAAATAAG AAATGTAAAA CATGATGGTA 5650 T P F L Q L N E I R N V K H D 240 AGACACTTTG GTGGGTTTCC TTCTTGAAGC TATTATTATC AAATTCCCTA 5700 TTCTTAGGAC TTGTTCTAGA CTAAAAGATA GTTAAGAGAT ATCCATCAAA 5750 | REPEAT | var(5743):[T:0.03] TACAATGTAT CAACCTAAAC TGGATGCTGG GGTTCTTTTT ACACCCTATA 5800 AAAGACATAC CTAAGACAAT CAGAGAAATA CAAATATGGA CTTGATTATT 5850 AGATAATATA GAAGGTTTAT TAATTTTCTT AGATGTGATC ATGGTATTGC 5900 AGTTTTAAAG GAGAACAATC TCCTGTTTAA GAGATACATG CTGAAATATT 5950 TACGGAGTTA AAGGTCACTG GACTCCAGAC TGGTGATAGA ACAAGACTCT 6000 | var(5987):[C:0.01] GTCTCTAAAA AATAATTAAT TTTTTAAAAG AAAATAGTTT GGTAAGATGA 6050 TTCTTACATT CTTAAATAAC ACGCCATCTA AGAAAAATGC TTTAACATAA 6100 ACATTACTGA AAAAATGCTA CATTTGCCAC AACTTCATAA AATGTCAAGT 6150 GAAATCTCAA GCTCCAAAGA TATTATTCCT ATTACTAAAT CTGATGTAAT 6200 AACATTTTAT TGATTCTAGG CATTCCTGCT GAATGTACCA CCATTTATAA 6250 | Exon 4 G I P A E C T T I Y N 251 CAGAGGTGAA CATACAAGTG GCATGTATGC CATCAGACCC AGCAACTCTC 6300 R G E H T S G M Y A I R P S N S 267 AAGTTTTTCA TGTCTACTGT GATGTTATAT CAGGTAAAAC CTGTCTAAGG 6350 Q V F H V Y C D V I S 278 AGAATAGACA GTAGTTAGTT CAACTTACTC ATTACGTATT AGGAAGATTA 6400 | var(6355):[C:0.01] | var(6390):[G:0.01] ACCTGGTTAT CATTGTTTTA TACATATATA TATGAAATAT ATATGAGTAT 6450 TCGTATAAAT ATAATACTTT TACCTTGTTT ATGTATTTAC TCAATATTCT 6500 CCTTTTCCTC TAAAATAATC TGAAGTGACT ATTATCAATA AGTTTACTAT 6550 GCCAAAATTC ATTAATTGCC TTTCACTTAA CTTTTGGGAC CATAATAAAT 6600 AATAAAATGT ATTGCCATAA CATTAATAAA CTACCTTACA AAACCACCAA 6650 TTAAAATCAA ACAAACAAAA AAGTGTTATT TACATCTGTC AACATAAATC 6700 TACTAAAAAT ACATGATTTC ATTCATTATA TTCAGGTAGT CCATGGACAT 6750 | Exon 5 G S P W T 283 TAATTCAACA TCGAATAGAT GGATCACAAA ACTTCAATGA AACGTGGGAG 6800 L I Q H R I D G S Q N F N E T W E 300 AACTACAAAT ATGGTTTTGG GAGGCTTGAT GGTAAGGGGA CTACATTCAA 6850 N Y K Y G F G R L D 310 TCATTCATTC ACTTGCTAAT CTACAAATAT TTACTGAGAA CCTCTTATGG 6900 | REPEAT ACCAGGTATT AGGAAAAGTA GTAACGAACG AGAAGCAGTC TCAGCCTTCA 6950 TATAATTTAT TATCAAACAA TTACACATTT GTTAGTAAAT TACACTTATT 7000 ACAACTGTTA TTATTTGAAT TATATTTATC ACAATTACAT GTCTGTTCTT 7050 AAATATACTT ATCACAATTT AATTCCACGG CTTACAATGA TCATAACTAT 7100 | var(7079):[A:0.02] AATTATTAAA GACAATTTTG ATTAAATGTT ATGTCATAAG TAGTAACTGT 7150 TACAAATAAG CTGTGAAAAG AACCACTCCT AGCATTAGTC ACTCTATTCT 7200 CTCATTAACG TTTTACATAT CAATTAATTG GAAGTTAAAA GGACCAGGAA 7250 | NOT SCANNED ACTCAGACAT ACAGTATACA TTTTAAAATT TCAATTATTT AAATATAATA 7300 TATAGAATGT ATGGCTTATA ATGAATTAGT T