Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 chi2 000138 CC 21 20 41 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 000200 CC 20 15 35 CT 1 6 7 TT 1 0 1 9.075 0.583 0.741 000527 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 000554 GG 24 22 46 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 000710 CC 21 16 37 CT 3 6 9 TT 0 1 1 0.107 0.195 0.253 000874 AA 0 2 2 AG 7 6 13 GG 17 15 32 0.700 1.252 0.208 001467 CC 21 20 41 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 001634 AA 4 4 8 AC 6 11 17 CC 12 8 20 3.035 0.004 1.567 001673 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 001771 CC 19 16 35 CT 3 6 9 TT 0 1 1 0.118 0.195 0.207 001840 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 19 21 40 0.118 0.048 0.156 002082 AA 5 3 8 AG 12 10 22 GG 7 10 17 0.001 0.040 0.037 002648 CC 0 2 2 CG 6 7 13 GG 15 14 29 0.583 0.616 0.120 002839 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 003015 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 003239 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 003303 AA 0 0 0 AC 0 3 3 CC 22 20 42 0.000 0.112 0.054 003348 GG 21 23 44 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 003396 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 003414 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 003439 CC 17 15 32 CG 7 7 14 GG 0 1 1 0.700 0.025 0.140 003460 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 003511 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 21 21 42 0.107 0.048 0.148 003875 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 003981 AA 14 10 24 AT 10 10 20 TT 0 3 3 1.662 0.040 0.189 003985 GG 22 16 38 GT 2 7 9 TT 0 0 0 0.045 0.741 0.527 004251 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 004363 AA 0 0 0 AG 7 4 11 GG 17 19 36 0.700 0.209 0.826 004462 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 004514 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 004691 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 004805 AA 18 23 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 006013 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 006510 CC 1 0 1 CT 4 1 5 TT 19 21 40 1.361 0.012 2.368 006830 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 006954 CC 24 20 44 CT 0 2 2 TT 0 1 1 0.000 4.707 10.729 007003 AA 0 0 0 AG 4 2 6 GG 20 21 41 0.198 0.048 0.218 007009 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 007069 AA 14 14 28 AT 10 6 16 TT 0 3 3 1.662 2.407 0.120 007119 GG 20 21 41 GT 4 2 6 TT 0 0 0 0.198 0.048 0.218 007135 AA 0 0 0 AG 4 2 6 GG 20 21 41 0.198 0.048 0.218 007252 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 008993 AA 23 20 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 009406 CC 17 15 32 CT 7 7 14 TT 0 1 1 0.700 0.025 0.140 009468 AA 0 0 0 AG 4 1 5 GG 20 20 40 0.198 0.012 0.156 009612 GG 23 19 42 GT 0 1 1 TT 0 1 1 0.000 8.629 18.871 009644 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 17 21 38 0.517 0.000 0.236 009737 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 009856 CC 21 21 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 009888 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 21 42 0.048 0.000 0.024 009966 CC 21 21 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 010179 CC 22 21 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.023 010632 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 010922 GG 16 19 35 GT 7 4 11 TT 0 0 0 0.741 0.209 0.848 011075 CC 19 15 34 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.118 0.263 0.357 011327 CC 21 17 38 CT 0 0 0 TT 0 1 1 0.000 18.000 39.000 011353 GG 12 10 22 GT 8 5 13 TT 1 3 4 0.053 2.148 0.912 011502 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 19 39 0.050 0.000 0.026 011885 -- 0 0 0 -+ 2 0 2 ++ 20 22 42 36.291 0.000 80.141 011970 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 012161 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 012257 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 012574 CC 0 0 0 CT 7 4 11 TT 16 19 35 0.741 0.209 0.848 012714 CC 21 17 38 CT 2 6 8 TT 1 0 1 4.959 0.517 0.516 012813 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 013258 AA 0 3 3 AG 9 9 18 GG 15 10 25 1.278 0.177 0.010 013795 AA 0 1 1 AG 4 6 10 GG 20 15 35 0.198 0.153 0.080 014211 -- 0 0 0 -+ 1 0 1 ++ 22 23 45 0.000 0.000 0.000 014271 CC 0 2 2 CG 4 4 8 GG 14 13 27 0.281 2.554 1.544 014305 CC 0 0 0 CT 5 3 8 TT 16 14 30 0.383 0.159 0.526 014447 CC 0 1 1 CT 5 7 12 TT 17 14 31 0.362 0.011 0.016 014466 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 014548 CC 0 1 1 CT 2 6 8 TT 21 15 36 0.048 0.153 0.450 014722 AA 1 0 1 AG 2 6 8 GG 21 17 38 4.959 0.517 0.516 014794 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 014981 CC 24 20 44 CT 0 2 2 TT 0 1 1 0.000 4.707 10.729 015030 CC 0 1 1 CT 6 7 13 TT 18 15 33 0.490 0.025 0.046 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 011885: A 014211: CTC