Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000109 T 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 000134 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000177 T 0.03 0.07 0.05 C 0.97 0.93 0.95 0.05 0.13 0.09 000300 G 0.03 0.07 0.05 A 0.97 0.93 0.95 0.05 0.13 0.09 000337 G 0.03 0.02 0.02 C 0.97 0.98 0.98 0.05 0.04 0.05 000539 T 0.07 0.12 0.10 C 0.93 0.88 0.90 0.14 0.21 0.18 000848 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000885 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001231 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 001266 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002119 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002511 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002578 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002754 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002764 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003510 G 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 004262 C 0.25 0.35 0.30 G 0.75 0.65 0.70 0.38 0.45 0.42 005374 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005521 A 0.19 0.35 0.27 C 0.81 0.65 0.73 0.30 0.45 0.39 005741 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005910 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006390 + 0.30 0.35 0.33 - 0.70 0.65 0.67 0.42 0.45 0.44 006752 T 0.25 0.34 0.30 A 0.75 0.66 0.70 0.38 0.45 0.42 006805 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006976 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007009 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007346 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007904 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008216 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008219 A 0.21 0.61 0.40 G 0.79 0.39 0.60 0.33 0.48 0.48 008618 + 0.17 0.32 0.24 - 0.83 0.68 0.76 0.29 0.43 0.36 009533 T 0.19 0.35 0.27 C 0.81 0.65 0.73 0.30 0.45 0.39 009668 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 009707 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009869 C 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 010134 - 0.12 0.24 0.18 + 0.88 0.76 0.82 0.22 0.36 0.29 010603 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 010750 A 0.10 0.07 0.09 G 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 010869 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011228 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011451 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011475 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011891 T 0.26 0.36 0.31 A 0.74 0.64 0.69 0.39 0.46 0.43 011898 T 0.07 0.02 0.05 A 0.93 0.98 0.95 0.12 0.05 0.09 012713 C 0.02 0.09 0.06 T 0.98 0.91 0.94 0.04 0.17 0.11 013041 - 0.18 0.61 0.42 + 0.82 0.39 0.58 0.30 0.48 0.49 013299 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013727 T 0.11 0.25 0.18 G 0.89 0.75 0.82 0.20 0.38 0.30 013752 G 0.25 0.36 0.31 T 0.75 0.64 0.69 0.38 0.46 0.43 013756 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014169 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014318 G 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 014327 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015301 A 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 015924 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 017027 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017556 T 0.11 0.07 0.09 G 0.89 0.93 0.91 0.19 0.13 0.16 018558 T 0.12 0.24 0.18 C 0.88 0.76 0.82 0.22 0.36 0.30 018742 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018826 - 0.09 0.05 0.07 + 0.91 0.95 0.93 0.16 0.09 0.12 020144 A 0.17 0.61 0.39 G 0.83 0.39 0.61 0.29 0.48 0.48 020969 G 0.21 0.64 0.43 A 0.79 0.36 0.57 0.34 0.46 0.49 021119 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 021386 G 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 021789 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 021818 - 0.20 0.24 0.22 + 0.80 0.76 0.78 0.33 0.36 0.35 021822 A 0.10 0.07 0.08 G 0.90 0.93 0.92 0.17 0.13 0.15 022438 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022522 G 0.21 0.24 0.22 T 0.79 0.76 0.78 0.33 0.36 0.35 022532 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023839 T 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 024558 G 0.09 0.05 0.07 T 0.91 0.95 0.93 0.17 0.10 0.13 024786 T 0.19 0.35 0.27 C 0.81 0.65 0.73 0.30 0.45 0.39 025235 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 025599 C 0.19 0.34 0.26 T 0.81 0.66 0.74 0.30 0.45 0.39 025613 - 0.02 0.04 0.03 + 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 025724 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 026344 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 026712 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027364 G 0.11 0.07 0.09 A 0.89 0.93 0.91 0.19 0.14 0.17 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005374: A 006390: CTTA 008618: AA 010134: T 013041: ATTC 018826: TA 021818: ATCCGTCTGTCCGTCC 025613: AATGGATTTTTAAATTA