Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000109 GG 21 19 40 GT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.118 0.056 000134 AA 21 21 42 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.012 0.006 000177 CC 19 19 38 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.013 0.118 0.105 000300 AA 19 19 38 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.013 0.118 0.105 000337 CC 19 21 40 CG 1 1 2 GG 0 0 0 0.013 0.012 0.025 000539 CC 17 16 33 CT 3 5 8 TT 0 0 0 0.131 0.383 0.479 000848 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 000885 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 001231 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 001266 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002119 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 22 42 0.012 0.000 0.006 002511 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 002578 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002754 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 002764 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 003510 AA 23 21 44 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.051 004262 CC 1 2 3 CG 9 12 21 GG 12 9 21 0.182 0.517 0.556 005374 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 005521 AA 0 2 2 AC 9 12 21 CC 15 9 24 1.278 0.517 0.979 005741 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 18 23 41 0.014 0.000 0.006 005910 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 006390 -- 9 9 18 +- 10 12 22 ++ 1 2 3 0.726 0.517 1.171 006752 AA 12 9 21 AT 9 11 20 TT 1 2 3 0.182 0.279 0.371 006805 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006976 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 007009 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 007346 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 007904 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 008216 CC 20 23 43 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 008219 AA 0 7 7 AG 10 14 24 GG 14 2 16 1.662 1.775 0.170 008618 -- 15 8 23 +- 8 10 18 ++ 0 1 1 1.019 0.903 1.380 009533 CC 15 9 24 CT 9 12 21 TT 0 2 2 1.278 0.517 0.979 009668 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 20 43 0.011 0.112 0.093 009707 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 009869 CC 0 0 0 CG 1 1 2 GG 22 20 42 0.011 0.012 0.024 010134 -- 0 1 1 +- 5 7 12 ++ 15 11 26 0.408 0.007 0.078 010603 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 22 20 42 0.011 0.112 0.095 010750 AA 0 0 0 AG 5 3 8 GG 19 20 39 0.324 0.112 0.407 010869 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 011228 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 011451 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 011475 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 011891 AA 12 8 20 AT 10 11 21 TT 1 2 3 0.374 0.416 0.655 011898 AA 20 20 40 AT 3 1 4 TT 0 0 0 0.112 0.012 0.100 012713 CC 0 0 0 CT 1 4 5 TT 21 18 39 0.012 0.220 0.160 013041 -- 0 7 7 +- 7 14 21 ++ 12 2 14 0.969 1.775 0.034 013299 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 013727 GG 17 12 29 GT 5 9 14 TT 0 1 1 0.362 0.182 0.212 013752 GG 1 2 3 GT 8 12 20 TT 11 8 19 0.089 0.702 0.546 013756 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 19 21 40 0.000 0.012 0.006 014169 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 014318 AA 23 20 43 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.011 0.112 0.093 014327 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 015301 AA 0 0 0 AT 0 2 2 TT 24 21 45 0.000 0.048 0.022 015924 CC 23 20 43 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.112 0.093 017027 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 017556 GG 19 20 39 GT 3 1 4 TT 1 1 2 2.457 9.075 9.162 018558 CC 18 13 31 CT 6 9 15 TT 0 1 1 0.490 0.130 0.280 018742 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 018826 -- 0 0 0 +- 4 2 6 ++ 19 20 39 0.209 0.050 0.230 020144 AA 0 7 7 AG 8 14 22 GG 15 2 17 1.019 1.775 0.001 020969 AA 12 1 13 AG 9 14 23 GG 0 7 7 1.562 3.094 0.356 021119 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 021386 GG 1 0 1 GT 2 0 2 TT 20 21 41 4.707 0.000 9.977 021789 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 021818 -- 1 1 2 +- 7 9 16 ++ 14 13 27 0.011 0.130 0.037 021822 AA 0 0 0 AG 4 3 7 GG 17 19 36 0.233 0.118 0.338 022438 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 022522 GG 1 1 2 GT 8 9 17 TT 15 13 28 0.003 0.130 0.084 022532 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 023839 AA 23 21 44 AT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 024558 GG 0 0 0 GT 4 2 6 TT 18 18 36 0.220 0.055 0.249 024786 CC 15 9 24 CT 9 12 21 TT 0 2 2 1.278 0.517 0.979 025235 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 20 43 0.011 0.112 0.093 025599 CC 0 2 2 CT 9 11 20 TT 15 9 24 1.278 0.279 0.747 025613 -- 0 0 0 +- 1 2 3 ++ 23 21 44 0.011 0.048 0.051 025724 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 026344 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 026712 CC 21 23 44 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 027364 AA 18 17 35 AG 5 3 8 GG 0 0 0 0.342 0.131 0.452 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005374: A 006390: CTTA 008618: AA 010134: T 013041: ATTC 018826: TA 021818: ATCCGTCTGTCCGTCC 025613: AATGGATTTTTAAATTA